Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Shmt2Q9CZN7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Shmt2Q9CZN7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms