Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9CYI0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CYI0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms