Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NubplQ9CWD8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms