Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lhfpl3Q9CTN8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms