Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhobtb3Q9CTN4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms