Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snw1Q9CSN1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snw1Q9CSN1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms