Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Filip1Q9CS72 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms