Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms