Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rab5aQ9CQD1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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