Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
1700029P11RikQ9CQ68 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms