Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg3Q9CPX6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms