Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gtf2ird2Q99NI3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gtf2ird2Q99NI3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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