Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms