Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tdrd1Q99MV1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms