Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PtprtQ99M80 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprtQ99M80 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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