Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pacsin3Q99JB8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pacsin3Q99JB8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms