Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apobec3Q99J72 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms