Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Smim11aQ99J19 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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