Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf144aQ925F3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms