Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb6Q922F4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms