Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Pde6cQ91ZQ1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde6cQ91ZQ1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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