Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp3Q91W36 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp3Q91W36 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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