Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zcchc18Q8VD24 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zcchc18Q8VD24 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms