Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hecw1Q8K4P8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms