Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Casc3Q8K3W3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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