Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Matr3Q8K310 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Matr3Q8K310 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Matr3Q8K310 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Matr3Q8K310 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matr3Q8K310 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms