Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud6bQ8K2H2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud6bQ8K2H2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms