Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkn3Q8K045 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms