Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccdc28aQ8CEI3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccdc28aQ8CEI3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccdc28aQ8CEI3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc28aQ8CEI3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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