Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ephb1Q8CBF3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms