Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spef2Q8C9J3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms