Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnot2Q8C5L3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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