Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Fam53cQ8BXQ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam53cQ8BXQ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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