Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik4Q8BMF5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms