Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nup93Q8BJ71 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms