Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rnf187Q8BFX1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rnf187Q8BFX1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rnf187Q8BFX1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rnf187Q8BFX1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rnf187Q8BFX1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rnf187Q8BFX1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf187Q8BFX1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf187Q8BFX1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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