Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Cldn34b3Q80ZS5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn34b3Q80ZS5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34b3Q80ZS5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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