Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcsk9Q80W65 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms