Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rims3Q80U57 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms