Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ube2q1Q7TSS2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ube2q1Q7TSS2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2q1Q7TSS2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms