Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdp1Q7TSG2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms