Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Dsg1cQ7TSF0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms