Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ckap2lQ7TS74 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms