Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Topbp1Q6ZQF0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms