Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trak1Q6PD31 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms