Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrimpolQ6P1E7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms