Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms