Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt39Q6IFX4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms