Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg9bQ6EBV9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms