Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scaf8Q6DID3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms